Немецкий национальный район Алтайского края был образован в июле 1991 года.
Районный суд Немецкого национального района Алтайского края создан на основании Федерального закона «О создании районного суда Немецкого национального района» от 27 декабря 2000 года № 158-ФЗ.
Приказом Судебного департамента при Верховном суде РФ «О распределении численности судов общей юрисдикции Российской Федерации», во вновь созданном суде установлена штатная численность в составе 2 судей.
Укомплектование штата судей районного суда Немецкого национального района Алтайского края началось с августа 2001 года.
Указом Президента РФ от 04 августа 2001 года судьей районного суда Немецкого национального района на трех летний срок полномочий был назначен Кромм В.А., который в марте 2005 года был назначен председателем Яровского районного суда.
Указом Президента РФ от 05 декабря 2001 года № 1407 председателем районного суда Немецкого национального района без ограничения срока полномочий была назначена Борисова Г.В. Введена в штат судей приказом Управления Судебного департамента в Алтайском крае от 13 декабря 2001 года № 374-л, с 13 декабря 2001 года.
Указом Президента РФ от 11 апреля 2006 года № 360 судьей районного суда Немецкого национального района на 3-летний срок полномочий назначен Берген В.П., введен в штат судей районного суда приказом Управления Судебного департамента в Алтайском крае с 19 апреля 2006 года. Указом Президента РФ от 10 июня 2009 года № 651 "О назначении судей районных судов" судьей районного суда Немецкого национального района без ограничения срока полномочий назначен Берген В.П.
04 декабря 2009 года председатель суда Борисова Г.В. ушла в отставку, согласно пиьменного заявления.
Указом Президента РФ от 09 января 2010 года № 38 председателем районного суда Немецкого национального района на 6-летний срок полномочий назначен Берген В.П.
Аппарат районного суда Немецкого национального района состоит из 7 человек: 2 помощника судьи, 2 секретаря судебного заседания, ведущий специалист, секретарь суда, специалист 2 разряда.